20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3522 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  349  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  67.78 
 
 
184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  58.12 
 
 
191 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  58.79 
 
 
201 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  56.5 
 
 
190 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  61.88 
 
 
188 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  56.28 
 
 
197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  51.4 
 
 
182 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  52.07 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  56.29 
 
 
182 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  51.16 
 
 
177 aa  164  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  48.35 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  51.97 
 
 
186 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  45.12 
 
 
185 aa  140  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  47.75 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  32.93 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  31.68 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  29.49 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  28.57 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
381 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>