13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3234 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  789    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101962  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0737  hypothetical protein  52.66 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4102  hypothetical protein  53.8 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1171  hypothetical protein  44.72 
 
 		 358 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1843  hypothetical protein  38.03 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4402  hypothetical protein  31.95 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.251004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4245  putative periplasmic protein  31.95 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4224  putative periplasmic protein  31.95 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1639  hypothetical protein  25.13 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.177634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5586  hypothetical protein  26.3 
 
 		 339 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.248705  normal  0.598616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.08 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  26.38 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  25.32 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>