25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3102 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2189  hypothetical protein  31.05 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0960654  hitchhiker  0.00117014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7185  putative signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  27.42 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  27.54 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0117  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5207  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  29.89 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 973 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 1359 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 960 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 		 468 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 127 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 1128 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 614 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  25.38 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  20.45 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>