10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2563 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  341  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.643471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7739  hypothetical protein  40.78 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00458321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3754  hypothetical protein  40.32 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4185  hypothetical protein  33.06 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2270  hypothetical protein  25.4 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5829  hypothetical protein  43.02 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3560  hypothetical protein  29.03 
 
 		 507 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1654  hypothetical protein  22.4 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5372  hypothetical protein  26.52 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  26.13 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>