160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3329 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  100 
 
 		 166 aa  329  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  93.37 
 
 		 169 aa  310  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  93.37 
 
 		 169 aa  310  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  93.37 
 
 		 169 aa  310  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  92.17 
 
 		 166 aa  310  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  92.17 
 
 		 166 aa  309  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  88.96 
 
 		 163 aa  301  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  90.8 
 
 		 163 aa  300  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  281  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  86.88 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  280  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  276  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  86.25 
 
 		 162 aa  276  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  71.88 
 
 		 163 aa  234  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  70.62 
 
 		 162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  67.5 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  68.12 
 
 		 162 aa  231  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  66.25 
 
 		 162 aa  226  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  65.64 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  223  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  67.92 
 
 		 163 aa  221  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  67.3 
 
 		 163 aa  221  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  64.38 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  65.62 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  65 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  64.38 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  66.67 
 
 		 163 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  63.12 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  62.26 
 
 		 160 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  59.01 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  61.97 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  56.69 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  47.3 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  47.26 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  49.32 
 
 		 189 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  43.59 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  43.87 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  44.12 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  44.31 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  44.12 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  49.32 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  46.9 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  40.24 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  41.94 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  42.38 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  44.52 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  42.38 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  41.94 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  38.79 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  47.44 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  42.21 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  42.21 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  35.1 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  39.29 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  40.71 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  35.1 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  35.47 
 
 		 197 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  37.25 
 
 		 188 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  37.96 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  33.54 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  34.56 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  35.34 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  36.92 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  38.69 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  35.38 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  35.38 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  30.94 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  38.41 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  31.54 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  36.15 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  34.78 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  34.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  33.85 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  34.62 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  31.06 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.58 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  30.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  32.85 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  30.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  32.12 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  27.39 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  30.26 
 
 		 248 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  39.62 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  29.46 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>