51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3791 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3791  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
344 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  71.43 
 
 
347 aa  512  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  69.79 
 
 
347 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0528  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  70.59 
 
 
344 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  68.36 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0507  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.9 
 
 
354 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3550  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.86 
 
 
350 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123013  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3724  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  67.16 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.265365  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0420  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.45 
 
 
354 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0406  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.57 
 
 
350 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0446  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.74 
 
 
354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0823821  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0432  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.03 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3894  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.03 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0476  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  63.91 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  63.08 
 
 
345 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4198  arginase family protein  69.43 
 
 
271 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.01 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09036  Formiminoglutamate hydrolase  34.87 
 
 
329 aa  182  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.122241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35 
 
 
323 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  26.07 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  26.07 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  25.68 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  26.05 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  24.9 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  26.21 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  28.08 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  26.27 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  26.69 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  28.08 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  26.54 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  27.95 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  26.79 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  25.42 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  24.75 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  25.87 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  24.91 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  26.69 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  26.72 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  24.44 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  24 
 
 
316 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  22.56 
 
 
319 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  22.56 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  27.98 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  26.97 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  27.7 
 
 
325 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  23.12 
 
 
285 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  24.7 
 
 
325 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  25.79 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  25.79 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.18 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>