13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2304 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  783    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0345  hypothetical protein  33.07 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.215943  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  31.69 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4047  hypothetical protein  31.42 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03050  hypothetical protein  27.38 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 585 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 551 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 575 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  27.93 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  27.88 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>