11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1604 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1604  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3225  putative lipoprotein  24.67 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  25.22 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  22.09 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  24.31 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  23.39 
 
 		 225 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  21.99 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  22.87 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  22.87 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  22.34 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>