17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4552 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  917    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  34.25 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  33.81 
 
 
419 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  30.89 
 
 
477 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  27.4 
 
 
482 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  27.97 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  30.56 
 
 
439 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  29.6 
 
 
445 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  29.07 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  29.07 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  28.61 
 
 
439 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  27.38 
 
 
463 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  29.81 
 
 
439 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  30.99 
 
 
428 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  31.85 
 
 
433 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  26.59 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  27.12 
 
 
495 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>