28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3486 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
1093 aa  2169    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  34.84 
 
 
1058 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  31.9 
 
 
1080 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  31.22 
 
 
1088 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  29.89 
 
 
1117 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  27.77 
 
 
989 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  30.09 
 
 
1126 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  25.13 
 
 
1040 aa  363  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  29.23 
 
 
1129 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  32.69 
 
 
996 aa  341  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  26.09 
 
 
1078 aa  331  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  26.14 
 
 
1078 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  30.23 
 
 
959 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  30.2 
 
 
1074 aa  278  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3731  Lanthionine synthetase C family protein  30.07 
 
 
1012 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.760247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3738  lanthionine synthetase C-like  31.81 
 
 
611 aa  251  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  27.99 
 
 
1068 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  25.28 
 
 
1033 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5313  Lanthionine synthetase C family protein  31.85 
 
 
1013 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4908  putative lantibiotic modification protein  30.79 
 
 
568 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6089  lanthionine synthetase C family protein  25.44 
 
 
973 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  23.2 
 
 
661 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5326  Lanthionine synthetase C family protein  26.81 
 
 
614 aa  92  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1493  Lanthionine synthetase C family protein  32.8 
 
 
437 aa  89.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.126791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09700  lantibiotic modifying enzyme  19.25 
 
 
610 aa  62.4  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 
713 aa  58.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4031  Lantibiotic modifying protein-like protein  26.26 
 
 
440 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304632  normal  0.0724238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  23.73 
 
 
414 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>