14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3247 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  56.11 
 
 
221 aa  256  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  33.64 
 
 
235 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  23.28 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  26.75 
 
 
204 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  23.26 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  28.57 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  26.62 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  32.32 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  24.43 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  26.28 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  25.56 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.79 
 
 
232 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  27.78 
 
 
231 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>