20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6504 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  78.23 
 
 		 518 aa  863    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1071    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  58.38 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  38.2 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  35.51 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  30.57 
 
 		 525 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  28.08 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  29.63 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  28.49 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  27.67 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  27.86 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  28.05 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  27.91 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  23.28 
 
 		 473 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  24.07 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  22.91 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  26.27 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1063 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  21.35 
 
 		 474 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0557  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>