11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5803 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5803    100 
 
 		 213 bp  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6496    90.57 
 
 		 1169 bp  268  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5962    93.71 
 
 		 1150 bp  212  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.650689  normal  0.599347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  82.46 
 
 		 1176 bp  125  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  86.71 
 
 		 1113 bp  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  86.36 
 
 		 267 bp  71.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  85.54 
 
 		 1269 bp  69.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  96.55 
 
 		 1140 bp  50.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6448  hypothetical protein  90 
 
 		 225 bp  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  79.39 
 
 		 1275 bp  46.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  88.37 
 
 		 1149 bp  46.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>