18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3899 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  100 
 
 		 321 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  55.27 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  50.78 
 
 		 335 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  27.74 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  27.8 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  27.85 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  46.67 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  35.53 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  32.89 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  27.3 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  26.14 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  30.34 
 
 		 127 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  30.26 
 
 		 128 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  26.43 
 
 		 233 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  30.26 
 
 		 128 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  24.07 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  24.53 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>