13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1690 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.748487  normal  0.448156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0262  protein of unknown function DUF982  61.33 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0234  protein of unknown function DUF982  58.67 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  41.33 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  39.74 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  37.33 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  36.62 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  35.53 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.586338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1634  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  42.86 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5427  protein of unknown function DUF982  30.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455574 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5628  protein of unknown function DUF982  37.04 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39932  normal  0.544028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>