21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1974 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1096    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  35.77 
 
 		 507 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  34.26 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  30.57 
 
 		 517 aa  243  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  29.6 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  32.43 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  25.7 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  25.71 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  25.93 
 
 		 474 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  25.2 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  25.97 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  30.46 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  29.43 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  25.08 
 
 		 474 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  26.06 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  24.68 
 
 		 473 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0557  hypothetical protein  43.64 
 
 		 58 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1063 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  28.07 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 1123 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>