19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1321 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1321  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193579  normal  0.134075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  71.43 
 
 
175 aa  253  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2126  hypothetical protein  69.75 
 
 
175 aa  227  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.742072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2216  hypothetical protein  69.75 
 
 
175 aa  227  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  40.34 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  36.84 
 
 
165 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  36.47 
 
 
171 aa  96.7  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0355  hypothetical protein  34.48 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  30.73 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  33.52 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  29.33 
 
 
200 aa  54.3  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  29.33 
 
 
213 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  29.69 
 
 
213 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  28.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  29.7 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  30.15 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  30.15 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  28.71 
 
 
220 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>