299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0059 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0091  tRNA-Val  96.1 
 
 		 78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.830426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0092  tRNA-Val  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0090  tRNA-Val  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0033  tRNA-Val  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.929932 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-1  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-2  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00946418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-3  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-4  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-5  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0556  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2175  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.527459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2568  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0023  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0226385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0172  tRNA-Val  92 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000143563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0076  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0009  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000461705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0062  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0009  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000748453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0062  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0076  tRNA-Val  95.16 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0020  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0018  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0062  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0038  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0035  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309036  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0083  tRNA-Val  90.67 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0413  tRNA-Val  90.67 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.117487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0020  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0061  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.03181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0053  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0069  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0543632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0084  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0086  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.211919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0011  tRNA-Val  94.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21800  tRNA-Val  93.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000344548  normal  0.0953285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  93.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000487057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t26  tRNA-Val  97.83 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t28  tRNA-Val  97.83 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t43  tRNA-Val  97.83 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0556993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60430  tRNA-Val  97.83 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  90.62 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  90.62 
 
 		 81 bp  79.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  90.62 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt40  tRNA-Val  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  97.67 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  90.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  90.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>