14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6973 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6973  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1387    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000276494  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4842  hypothetical protein  31.24 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4930  hypothetical protein  31.24 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3858  hypothetical protein  31.49 
 
 		 680 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611595  normal  0.0467338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2309  hypothetical protein  31.62 
 
 		 666 aa  333  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.444355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0935  hypothetical protein  30.93 
 
 		 646 aa  316  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.002395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52360  hypothetical protein  31.57 
 
 		 665 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3659  ATPase, putative  31.92 
 
 		 667 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0800074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1436  ATPase, putative  31.05 
 
 		 672 aa  253  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.120762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3861  hypothetical protein  23.5 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3190  hypothetical protein  25.94 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1178  hypothetical protein  24.06 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0305032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3557  hypothetical protein  24.06 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0398758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0229  ATPase family protein  30.51 
 
 		 626 aa  44.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00298001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>