27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6480 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  100 
 
 		 938 aa  1947    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  27.65 
 
 		 878 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  25.35 
 
 		 862 aa  219  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  24.51 
 
 		 892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  26.29 
 
 		 890 aa  217  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  24.08 
 
 		 899 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  25.14 
 
 		 893 aa  204  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  23.95 
 
 		 899 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  25.86 
 
 		 901 aa  197  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  27.9 
 
 		 835 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  24.63 
 
 		 888 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  23.43 
 
 		 910 aa  167  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  25.58 
 
 		 881 aa  162  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  27.22 
 
 		 820 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  28.1 
 
 		 815 aa  108  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  24.89 
 
 		 846 aa  93.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  24.84 
 
 		 844 aa  93.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  23.53 
 
 		 832 aa  84.7  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  25 
 
 		 714 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  23.78 
 
 		 674 aa  55.8  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  25 
 
 		 714 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  25 
 
 		 714 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  25.33 
 
 		 714 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  23.08 
 
 		 679 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  24.11 
 
 		 714 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  21.38 
 
 		 726 aa  50.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  29.14 
 
 		 185 aa  49.7  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>