23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5627 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5627  Anthranilate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 419 aa  866    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0229833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2176  Glycosyl transferase, family 3-like protein  28.43 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.261801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1315  hypothetical protein  27.46 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.250001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0270  anthranilate phosphoribosyltransferase-like protein  27.92 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4702  Glycosyl transferase, family 3-like protein  23.12 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  27.71 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  27.71 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  28.34 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  28.34 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  25.91 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  30.47 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  25.79 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  25.71 
 
 		 333 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  25.73 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  25.27 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  32.98 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  34.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0088  glycosyl transferase family 3  28 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  31.17 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>