23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4228 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 661 aa  1361    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5326  Lanthionine synthetase C family protein  27.01 
 
 		 614 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  26.98 
 
 		 1129 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  26.17 
 
 		 1058 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  26.2 
 
 		 1126 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  27.15 
 
 		 1088 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  25.65 
 
 		 1080 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  27.61 
 
 		 1117 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  28.62 
 
 		 1074 aa  97.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  23.65 
 
 		 1093 aa  94.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  26.55 
 
 		 1078 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  26.55 
 
 		 1078 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  24.48 
 
 		 989 aa  87.8  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  22.58 
 
 		 1040 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3589  Lantibiotic modifying protein-like protein  23.66 
 
 		 382 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  30.38 
 
 		 1068 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1973  lanthionine synthetase C-like protein  26.52 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  28.99 
 
 		 409 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0217  Lanthionine synthetase C family protein  19.8 
 
 		 411 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  21.99 
 
 		 1033 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  27.75 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  21.62 
 
 		 491 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>