19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3875 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  39.48 
 
 		 238 aa  167  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  33.81 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  31.82 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  31.22 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  29.78 
 
 		 233 aa  89.4  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  32.28 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  37.71 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  34.31 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  26.91 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  32.32 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  29.27 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  30.98 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  28 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  29.29 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  26.25 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  26.25 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>