30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36760  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04620  hypothetical protein  50 
 
 
257 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2395  hypothetical protein  45.28 
 
 
252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0092  hypothetical protein  41.7 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0107  hypothetical protein  51.1 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2871  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2077  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2933  hypothetical protein  34.16 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0694747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0227  hypothetical protein  42.16 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482359  normal  0.182305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15680  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3163  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.964275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3185  hypothetical protein  32.92 
 
 
236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3182  hypothetical protein  35.25 
 
 
236 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0937761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3178  hypothetical protein  32.92 
 
 
236 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2954  hypothetical protein  32.92 
 
 
236 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.032599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2907  hypothetical protein  34.17 
 
 
232 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3191  hypothetical protein  34.48 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3758  hypothetical protein  43.15 
 
 
280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1019  hypothetical protein  40.61 
 
 
259 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145957  normal  0.277845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2666  hypothetical protein  35.98 
 
 
280 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.490325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3629  hypothetical protein  38.07 
 
 
245 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.267254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1544  hypothetical protein  41.81 
 
 
254 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2125  hypothetical protein  29.63 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17270  predicted membrane protein  31.89 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.692872  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1499  hypothetical protein  36.1 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0226189 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0521  hypothetical protein  28.1 
 
 
236 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2249  hypothetical protein  34.5 
 
 
253 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0862761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0814  hypothetical protein  29 
 
 
248 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46456  predicted protein  31.95 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1370  hypothetical protein  42.11 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000145886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>