252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  100 
 
 		 56 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  83.33 
 
 		 55 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  80.77 
 
 		 54 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 		 55 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  84 
 
 		 55 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  77.78 
 
 		 55 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  75 
 
 		 54 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4730  50S ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4816  50S ribosomal protein L33  78.85 
 
 		 54 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.504852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 54 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  75.93 
 
 		 55 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  70.37 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  72.22 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  72.22 
 
 		 55 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  70.37 
 
 		 55 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 54 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  58.93 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12094  50S ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 54 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 56 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 51 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  62.96 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  53.06 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0927  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876477  normal  0.594251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  59.18 
 
 		 51 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  57.78 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  60.47 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2140  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1383  50S ribosomal protein L33  57.78 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475862  normal  0.535543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1291  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070156  hitchhiker  0.00170848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 51 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3181  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1990  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 51 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 51 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  57.78 
 
 		 55 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>