41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31130  uncharacterized protein, possibly involved in motility  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188093  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2018  flagellar FlbD family protein  60.92 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184635  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1659  flagellar FlbD family protein  53.25 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0969  flagellar FlbD family protein  50 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2982  flagellar FlbD family protein  41.98 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.31027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0850  flagellar FlbD family protein  53.12 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.718812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2338  flagellar FlbD family protein  45 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0750  flagellar FlbD family protein  40.24 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1401  flagellar FlbD family protein  39.73 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.207485  normal  0.631836 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0254  flagellar FlbD family protein  39.29 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4145  flagellar FlbD family protein  37.04 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0256  flagellar FlbD family protein  39.29 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1120  flagellar FlbD family protein  44.07 
 
 
72 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2041  flagellar FlbD family protein  39.34 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.250261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2163  flagellar FlbD family protein  41.07 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1294  flagellar FlbD family protein  38.6 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2707  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2934  hypothetical protein  46 
 
 
74 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0462  flagellar protein  40 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1536  flagellar FlbD family protein  35.71 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0051  flagellar FlbD family protein  42.31 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1683  flagellar FlbD family protein  31.58 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0859  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0288  hypothetical protein  28.79 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3026  flagellar protein FlbD, putative  35.59 
 
 
92 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2012  flagellar FlbD family protein  38.64 
 
 
74 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0109  flagellar FlbD family protein  36.36 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000361803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1327  flagellar FlbD family protein  29.82 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1314  flagellar FlbD family protein  28.57 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2767  flagellar protein-related protein  30.77 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000927722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3472  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2567  flagellar FlbD family protein  38.6 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0146  flagellar FlbD family protein  37.5 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2471  flagellar FlbD family protein  38.6 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4078  flagellar FlbD family protein  30.51 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.678438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1386  flagellar protein  38.6 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1016  flagellar FlbD family protein  29.82 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3837  flagellar FlbD family protein  33.9 
 
 
89 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3753  flagellar FlbD family protein  33.9 
 
 
85 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0780  flagellar  30.77 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00539168  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0475  flagellar protein  43.75 
 
 
96 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>