22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  35.62 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  37.55 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  39.3 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  40.61 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  31.78 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  29.6 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 441 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  37.75 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  36.42 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  43.37 
 
 		 169 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 		 390 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  32.24 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 456 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  34.91 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  36.53 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  31.43 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  29.08 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>