16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3880 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4083  hypothetical protein  98.68 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3973  hypothetical protein  94.7 
 
 		 151 aa  275  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4725  hypothetical protein  84.77 
 
 		 151 aa  269  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0076  hypothetical protein  78.38 
 
 		 151 aa  249  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.928332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4323  hypothetical protein  78.38 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4463  hypothetical protein  78.38 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4268  hypothetical protein  78.38 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3885  hypothetical protein  64.9 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3689  hypothetical protein  56.55 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4103  hypothetical protein  52.7 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3923  hypothetical protein  55.86 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0211  hypothetical protein  48.73 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0118  hypothetical protein  52.05 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0079  hypothetical protein  48.99 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0118  hypothetical protein  46.79 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>