15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3635 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  97.77 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  36.18 
 
 		 211 aa  95.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  35.68 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  29.17 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  31.79 
 
 		 208 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  29.56 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  27.86 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  27.36 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  27.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  27.32 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  26.83 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  27.05 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  26.06 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>