54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0420 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0446  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.33 
 
 
354 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0823821  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0432  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.33 
 
 
354 aa  705    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0420  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
354 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0507  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  90.4 
 
 
354 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3894  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.33 
 
 
354 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015316  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0406  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  84.75 
 
 
350 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3550  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  85.03 
 
 
350 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123013  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3724  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  84.46 
 
 
350 aa  617  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.265365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4198  arginase family protein  85.09 
 
 
271 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.14 
 
 
347 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0528  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.86 
 
 
344 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3791  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  64.45 
 
 
344 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.32 
 
 
338 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.46 
 
 
347 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0476  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  61.89 
 
 
342 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  61.21 
 
 
345 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.28 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09036  Formiminoglutamate hydrolase  33.33 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.122241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.74 
 
 
323 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  25.26 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  28.04 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  25.61 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  24.91 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  24.91 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  29.23 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  29.59 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  24.49 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  29.38 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  24.21 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  29.52 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  30.77 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  26.83 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  25.78 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  27.89 
 
 
329 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  28.17 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  28.17 
 
 
325 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  31.79 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  25.77 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  26.43 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  24.77 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  25.77 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  25.77 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.29 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.27 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  24 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  26.52 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  23.88 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  23.29 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  26.75 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  27.39 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  27.78 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  25.73 
 
 
300 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  26.49 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>