17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2085 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2085  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  383  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.025196  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2437  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  28.11 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  27.17 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0752  hypothetical protein  25.3 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  22.75 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0202  hypothetical protein  25.42 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2208  putative lipoprotein  24.24 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  27.2 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0767  hypothetical protein  29.6 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2299  putative lipoprotein  21.31 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.340663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1426  putative lipoprotein  22.81 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0143558  normal  0.124121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2726  hypothetical protein  25.62 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.115965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  23.85 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2910  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0056  hypothetical protein  26.24 
 
 
192 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0125376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0727  hypothetical protein  24.78 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0156781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>