20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1183 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  328  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2400  hypothetical protein  32.43 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.763825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  27.88 
 
 
194 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  31.13 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  30.83 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  41.1 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  34.69 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1973  hypothetical protein  32.11 
 
 
271 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  41.18 
 
 
194 aa  47.4  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  36.23 
 
 
199 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  25.29 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  32.98 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  31.18 
 
 
182 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  34.29 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  34.29 
 
 
208 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  34.29 
 
 
208 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  32.11 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  32.86 
 
 
253 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>