12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1090 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  36.03 
 
 
392 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  35.25 
 
 
684 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  35.06 
 
 
689 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  33.7 
 
 
504 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  36.15 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  36 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  23.6 
 
 
552 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  23.6 
 
 
552 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  27.86 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2815  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  24.68 
 
 
476 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>