13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3063 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  291  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0556  hypothetical protein  75.18 
 
 		 142 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3979  hypothetical protein  75.86 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  66.67 
 
 		 129 aa  189  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0748  hypothetical protein  68.07 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3570  hypothetical protein  68.07 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.217533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3691  hypothetical protein  68.07 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  normal  0.0136515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3502  hypothetical protein  68.07 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  38.33 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  22.31 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  24.58 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>