More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1928 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  50.73 
 
 		 886 aa  892    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  50.56 
 
 		 886 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  42.45 
 
 		 901 aa  679    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.06 
 
 		 886 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  50.33 
 
 		 886 aa  896    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  80.02 
 
 		 903 aa  1466    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 		 903 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  43.16 
 
 		 897 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  47.27 
 
 		 904 aa  824    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  50.73 
 
 		 886 aa  892    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.17 
 
 		 886 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  80.92 
 
 		 899 aa  1467    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  50.95 
 
 		 886 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  51.28 
 
 		 880 aa  870    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  51.28 
 
 		 880 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  45.7 
 
 		 911 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  45.2 
 
 		 913 aa  815    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  80.38 
 
 		 901 aa  1465    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  80.27 
 
 		 905 aa  1465    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.06 
 
 		 886 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  51.79 
 
 		 882 aa  880    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  77.01 
 
 		 896 aa  1442    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  43.28 
 
 		 903 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  40.36 
 
 		 893 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 		 898 aa  767    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  70.56 
 
 		 899 aa  1271    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  50.56 
 
 		 886 aa  897    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 		 893 aa  688    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  76.23 
 
 		 896 aa  1407    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  77.17 
 
 		 900 aa  1454    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  40.02 
 
 		 896 aa  675    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  50.44 
 
 		 886 aa  893    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  80.38 
 
 		 901 aa  1467    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  79.91 
 
 		 913 aa  1464    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  80.02 
 
 		 913 aa  1466    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 900 aa  1853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  77.23 
 
 		 898 aa  1414    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  50.11 
 
 		 893 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  51.28 
 
 		 880 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  40.36 
 
 		 900 aa  667    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  80.49 
 
 		 901 aa  1469    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  50.62 
 
 		 894 aa  886    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  51.22 
 
 		 888 aa  885    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  50.84 
 
 		 887 aa  876    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  80.13 
 
 		 904 aa  1464    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.17 
 
 		 886 aa  907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  48.97 
 
 		 877 aa  838    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  50.56 
 
 		 886 aa  894    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  49.66 
 
 		 877 aa  842    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  51.9 
 
 		 882 aa  877    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  50.56 
 
 		 886 aa  895    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  51.67 
 
 		 882 aa  887    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  75.45 
 
 		 911 aa  1394    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  50.67 
 
 		 886 aa  895    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  50.95 
 
 		 887 aa  900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  52.28 
 
 		 897 aa  947    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  43.35 
 
 		 898 aa  735    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.79 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 		 890 aa  632  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 		 915 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  37.53 
 
 		 895 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  37.71 
 
 		 897 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.08 
 
 		 929 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  37.32 
 
 		 911 aa  602  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  37 
 
 		 905 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  36.56 
 
 		 892 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 897 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 		 887 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  36.25 
 
 		 915 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  36.75 
 
 		 915 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  37.17 
 
 		 907 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 		 899 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  38 
 
 		 902 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 893 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  36.75 
 
 		 921 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  37.31 
 
 		 897 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  36.23 
 
 		 912 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.83 
 
 		 918 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 907 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.56 
 
 		 907 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 		 906 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  37.02 
 
 		 920 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  35.86 
 
 		 903 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 893 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  32.85 
 
 		 918 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  32.96 
 
 		 901 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  32.96 
 
 		 908 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 895 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 897 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 		 904 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 896 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 		 900 aa  485  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 892 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 918 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 		 892 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  34.04 
 
 		 886 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 		 891 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 		 900 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 		 900 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>