24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1730 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  66.04 
 
 		 237 aa  290  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  61.75 
 
 		 234 aa  287  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  64.02 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  62.74 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  64.32 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  64.32 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  64.32 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  64.32 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  64.59 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  62.78 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  64.11 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  64.59 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  62.26 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  58.72 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  52.27 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  44.32 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  31.71 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  30.29 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1977  hypothetical protein  24.29 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153346  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  34.18 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6617  hypothetical protein  23.94 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>