28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1713 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  98.18 
 
 
714 aa  1430    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  98.46 
 
 
714 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  100 
 
 
714 aa  1454    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  56.32 
 
 
726 aa  782    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  98.04 
 
 
714 aa  1429    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  98.32 
 
 
714 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  30.53 
 
 
820 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  30.09 
 
 
815 aa  330  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  30.63 
 
 
844 aa  328  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  30.88 
 
 
832 aa  320  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  28.82 
 
 
846 aa  296  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  29.86 
 
 
674 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  29.86 
 
 
679 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  28.17 
 
 
743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  28.15 
 
 
910 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  29.61 
 
 
881 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  28 
 
 
893 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  28.44 
 
 
888 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  25.33 
 
 
899 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  25.11 
 
 
899 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  21.53 
 
 
878 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  22.2 
 
 
901 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  25 
 
 
890 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  23.01 
 
 
892 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  27.41 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  21.75 
 
 
835 aa  55.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  22.31 
 
 
938 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  20.05 
 
 
862 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>