18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1592 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  49.93 
 
 		 701 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  100 
 
 		 861 aa  1787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  25.91 
 
 		 834 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  31.4 
 
 		 857 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  28.6 
 
 		 520 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  26.32 
 
 		 847 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  24.71 
 
 		 829 aa  151  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  22.75 
 
 		 845 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  25.6 
 
 		 840 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  26.31 
 
 		 859 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  23.27 
 
 		 674 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  29.77 
 
 		 1284 aa  45.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  28.26 
 
 		 749 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.64 
 
 		 1381 aa  44.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  22.44 
 
 		 646 aa  44.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  31.67 
 
 		 669 aa  44.3  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5098  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.63 
 
 		 465 aa  44.3  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  25.48 
 
 		 799 aa  44.3  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>