37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0632 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  76.16 
 
 		 155 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  71.52 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  72.48 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  64.52 
 
 		 166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  63.51 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  67.42 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  63.12 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  54.05 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  52 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  52 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  51.33 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  50 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  46.5 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  54.96 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  47.97 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  47.62 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  47.3 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  46.62 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  46.62 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  44.67 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  49.24 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  48.03 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  45.95 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  48.48 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  48.48 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  46.79 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  44.74 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  47.37 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  50.38 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  52 
 
 		 99 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  48.54 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  33.58 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  36.96 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2037  hypothetical protein  31.52 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000278409  normal  0.0587527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>