15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2998 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1892    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  31.49 
 
 		 831 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  31.83 
 
 		 821 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  22.49 
 
 		 831 aa  196  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  22.93 
 
 		 921 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  22.85 
 
 		 895 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  24.81 
 
 		 863 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  27.27 
 
 		 866 aa  150  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1193 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  22.02 
 
 		 900 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  26.46 
 
 		 2204 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1131 aa  99  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1131 aa  99  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  39.08 
 
 		 649 aa  46.2  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  42.86 
 
 		 650 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>