207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1980 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  71.68 
 
 		 463 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  67.82 
 
 		 467 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 471 aa  954    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  68.74 
 
 		 465 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  69.4 
 
 		 465 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  70.97 
 
 		 471 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  67.77 
 
 		 460 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  66.23 
 
 		 460 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  65.79 
 
 		 458 aa  611  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  64.29 
 
 		 483 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  53.22 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  52.79 
 
 		 448 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  52.27 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  53.39 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  52.23 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1516  Nitric-oxide reductase  52.91 
 
 		 451 aa  458  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  50.85 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  50.74 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  49.56 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  49.47 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1968  cytochrome c oxidase, subunit I  49.03 
 
 		 446 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  47.74 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1849  cytochrome c oxidase, subunit I  48.48 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0823  nitric-oxide reductase subunit B  44.37 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1255  nitric-oxide reductase subunit B  42.7 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3435  cytochrome c oxidase, subunit I  43.58 
 
 		 457 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464275  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2767  Nitric-oxide reductase  43.36 
 
 		 457 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  39.4 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  38.76 
 
 		 457 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  41.93 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  39.56 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  39.86 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  30.67 
 
 		 787 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2253  Nitric-oxide reductase  30.22 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  28 
 
 		 748 aa  146  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  30.14 
 
 		 739 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  29.4 
 
 		 776 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.15 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  28.03 
 
 		 773 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  27.13 
 
 		 762 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  28.98 
 
 		 773 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.34 
 
 		 761 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  27.78 
 
 		 1077 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  27.34 
 
 		 518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  28.1 
 
 		 772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  28.1 
 
 		 772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  28.1 
 
 		 772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  26.82 
 
 		 762 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  27.04 
 
 		 762 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.9 
 
 		 762 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.23 
 
 		 761 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  29.77 
 
 		 758 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.23 
 
 		 761 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.53 
 
 		 760 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.23 
 
 		 761 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.54 
 
 		 762 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  25.41 
 
 		 780 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  26.57 
 
 		 767 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  25.12 
 
 		 762 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.46 
 
 		 758 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  25.88 
 
 		 758 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.39 
 
 		 763 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  25.18 
 
 		 780 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  26.42 
 
 		 769 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  25.18 
 
 		 774 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.3 
 
 		 761 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  27.05 
 
 		 769 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  27.78 
 
 		 746 aa  103  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  25.35 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  25.58 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  25.58 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  26.98 
 
 		 758 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.98 
 
 		 758 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  31.02 
 
 		 762 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  26.16 
 
 		 756 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  27.72 
 
 		 840 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  28.48 
 
 		 720 aa  99.8  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  25.45 
 
 		 764 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  27.1 
 
 		 743 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  30.42 
 
 		 763 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  27.21 
 
 		 756 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  23.77 
 
 		 744 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  25.85 
 
 		 759 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  24.76 
 
 		 763 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  27.05 
 
 		 759 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  23.66 
 
 		 761 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  26.14 
 
 		 783 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  25.45 
 
 		 761 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  24.27 
 
 		 763 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  25.9 
 
 		 783 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  25.9 
 
 		 783 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  24.51 
 
 		 763 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  28.66 
 
 		 734 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  25.37 
 
 		 769 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  24.82 
 
 		 768 aa  90.1  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>