55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0462 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 338 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0476  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  69.14 
 
 		 342 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3791  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  68.36 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3550  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.4 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0406  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.1 
 
 		 350 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0251824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3724  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.4 
 
 		 350 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.265365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0528  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.95 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0446  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  63.48 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0823821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0432  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  63.48 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.28 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0420  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.32 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3894  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.9 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0507  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.32 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.57 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  60.95 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4198  arginase family protein  66.79 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.92 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.72 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09036  Formiminoglutamate hydrolase  35.59 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.122241  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  26.56 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  26.17 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  26.56 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  26.17 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  26.25 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  28 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  25.68 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  27.72 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  26.37 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  30.59 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  27.08 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  24.07 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  27.08 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.1 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  26.37 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  28.63 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  28.14 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  26.49 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  28.28 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  25.75 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  27.51 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  26.4 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  23.46 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  24.04 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  26.56 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  27.78 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  26.01 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  25.94 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  24.46 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.6 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  26.11 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  26.11 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  24.35 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  23.62 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  24.27 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  25.09 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>