17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1701 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  100 
 
 
91 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  46.51 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  43.02 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  41.11 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  38.2 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  39.02 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  37.8 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  48.08 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  48.08 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  37.04 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  33.96 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  42.22 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  42.55 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  41.67 
 
 
79 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  43.48 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  41.46 
 
 
75 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>