14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0560 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1120  outer membrane insertion C-terminal signal  52.36 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000147263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  29.9 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  27.62 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  27.98 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  25.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  27.96 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  27.6 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  27.49 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003008  hypothetical protein  28.07 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1092  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.033625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2255  hypothetical protein  24.16 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>