26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2891 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  29.37 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  33.82 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  31.43 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  27.86 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  28.26 
 
 
122 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  30.47 
 
 
123 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  30.47 
 
 
123 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  29.69 
 
 
123 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  29.63 
 
 
125 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  30.6 
 
 
123 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  30.6 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  27.66 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  26.5 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  27.17 
 
 
127 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  27.17 
 
 
127 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  27.17 
 
 
127 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  27.17 
 
 
128 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  27.17 
 
 
128 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  26.5 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  26.5 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  27.17 
 
 
128 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  22.31 
 
 
122 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  26.17 
 
 
127 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>