15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0917 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  37.43 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  34.33 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  34.8 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06070  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0235  Sporulation domain protein  31.82 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  29.63 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3655  Sporulation domain protein  29.03 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4290  sporulation domain-containing protein  40.74 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000142012  hitchhiker  0.00000290664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  27.34 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0612  hypothetical protein  33.8 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.653535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  33.78 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>