17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0225 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  100 
 
 		 208 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  30.63 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  31.28 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  31.91 
 
 		 239 aa  84.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  28.24 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  28.25 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  25.13 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  25.23 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  32.32 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  23.58 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  23.65 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0462  hypothetical protein  32.61 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  23.77 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  26.94 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  31.73 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  26.48 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>