18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2380 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  95.04 
 
 
151 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  94.21 
 
 
121 aa  233  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  93.39 
 
 
121 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  47.9 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  49.11 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  41.18 
 
 
119 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  44.74 
 
 
119 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  55.79 
 
 
112 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  40.68 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  42.48 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  35.06 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  30.34 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  37.5 
 
 
210 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  36.67 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0246  hypothetical protein  27.05 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.999581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  31.25 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>