49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2383 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2708  Alkanesulfonate monooxygenase  96.6 
 
 		 1146 bp  1963    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00946  hypothetical protein  96.6 
 
 		 1146 bp  1963    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1097  alkanesulfonate monooxygenase  96.51 
 
 		 1146 bp  1955    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0063257  normal  0.316235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2383    100 
 
 		 1146 bp  2272    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2184  alkanesulfonate monooxygenase  95.29 
 
 		 1146 bp  1844    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2661  alkanesulfonate monooxygenase  96.6 
 
 		 1146 bp  1963    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.499815  normal  0.0111176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00939  alkanesulfonate monooxygenase  96.6 
 
 		 1146 bp  1963    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1037  alkanesulfonate monooxygenase  99.56 
 
 		 1146 bp  2232    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1044  alkanesulfonate monooxygenase  96.6 
 
 		 1146 bp  1963    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1454  alkanesulfonate monooxygenase  79.8 
 
 		 1146 bp  234  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1737  alkanesulfonate monooxygenase  82.26 
 
 		 1149 bp  143  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44148  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2418  alkanesulfonate monooxygenase  82.32 
 
 		 1164 bp  95.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.937223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5413  alkanesulfonate monooxygenase  82.67 
 
 		 1149 bp  91.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592589  hitchhiker  0.0021223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1683  alkanesulfonate monooxygenase  80.5 
 
 		 1149 bp  87.7  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0262  alkanesulfonate monooxygenase  90.77 
 
 		 1149 bp  81.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4322  alkanesulfonate monooxygenase  89.23 
 
 		 1149 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0253  alkanesulfonate monooxygenase  89.23 
 
 		 1149 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393943  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0770  Alkanesulfonate monooxygenase  80 
 
 		 1188 bp  73.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0238  alkanesulfonate monooxygenase  89.23 
 
 		 1149 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30500  alkanesulfonate monooxygenase  80 
 
 		 1149 bp  71.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1643  alkanesulfonate monooxygenase  80.24 
 
 		 1149 bp  69.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2384    100 
 
 		 837 bp  69.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3044  alkanesulfonate monooxygenase  86.67 
 
 		 1176 bp  69.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301199  normal  0.0454974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1674  alkanesulfonate monooxygenase  88.71 
 
 		 1149 bp  67.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0025  alkanesulfonate monooxygenase  80.38 
 
 		 1143 bp  67.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19560  alkanesulfonate monooxygenase  79.1 
 
 		 1149 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1215  alkanesulfonate monooxygenase  79.77 
 
 		 1164 bp  65.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.117303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1866  alkanesulfonate monooxygenase  84.71 
 
 		 1176 bp  65.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1278  alkanesulfonate monooxygenase  85.53 
 
 		 1164 bp  63.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.4658  normal  0.0527659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0031  alkanesulfonate monooxygenase  86.76 
 
 		 1143 bp  63.9  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4974  alkanesulfonate monooxygenase  80 
 
 		 1149 bp  63.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0541962  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4638  alkanesulfonate monooxygenase  85.53 
 
 		 1161 bp  63.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211396  hitchhiker  0.00000269993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1339  alkanesulfonate monooxygenase  85.33 
 
 		 1164 bp  61.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1976  alkanesulfonate monooxygenase  79.41 
 
 		 1164 bp  60  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3456  alkanesulfonate monooxygenase  88.68 
 
 		 1188 bp  58  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5016  aliphatic sulfonate monooxygenase  90.91 
 
 		 1146 bp  56  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000170849  normal  0.183828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43870  Alkanesulfonate monooxygenase  79.17 
 
 		 1134 bp  56  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4291    83.13 
 
 		 750 bp  54  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1542  alkanesulfonate monooxygenase  83.13 
 
 		 1164 bp  54  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396706  normal  0.848175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2976  alkanesulfonate monooxygenase  87.04 
 
 		 1170 bp  52  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2305  Alkanesulfonate monooxygenase  88 
 
 		 1188 bp  52  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.302323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2788  alkanesulfonate monooxygenase  86.79 
 
 		 1149 bp  50.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1744  alkanesulfonate monooxygenase  86.79 
 
 		 1161 bp  50.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1777  alkanesulfonate monooxygenase  91.67 
 
 		 1143 bp  48.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1670  alkanesulfonate monooxygenase  88.64 
 
 		 1158 bp  48.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1213  alkanesulfonate monooxygenase  82.14 
 
 		 1209 bp  48.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0354  alkanesulfonate monooxygenase  80.77 
 
 		 1149 bp  48.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34190  methanesulfonate sulfonatase MsuD  85.71 
 
 		 1146 bp  48.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0359652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0422  alkanesulfonate monooxygenase  80.77 
 
 		 1149 bp  48.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>