58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1933 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1933  phage capsid scaffolding protein (GpO)  100 
 
 		 294 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.792365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3832  capsid scaffolding  71.88 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1278  hypothetical protein  79.67 
 
 		 125 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.238207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1218  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  65.87 
 
 		 131 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4929  hypothetical protein  66.17 
 
 		 154 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3474  putative phagelysin  61.9 
 
 		 133 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.352563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2334  bacteriophage P7 related protein  54.62 
 
 		 131 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3049  phage capsid scaffolding protein  55.15 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00834  putative capsid scaffolding protein  55.15 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0925  phage capsid scaffolding protein  55.15 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00842  hypothetical protein  55.15 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2867  phage capsid scaffolding protein  54.41 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2776  capsid scaffolding  54.41 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569535  decreased coverage  0.0000191582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0412  M15 family peptidase  48.82 
 
 		 133 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2328  capsid scaffolding  51.47 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1351  Phage capsid scaffolding protein (GPO)  50.34 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0476  putative phage-related protein  48.82 
 
 		 133 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.877845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1185  M15 family peptidase  48.82 
 
 		 133 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4365  phage capsid scaffolding protein GpO  45.21 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1398  phage capsid scaffolding  48.53 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3500  phage capsid scaffolding  38.59 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.182545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2642  capsid scaffolding  48.18 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3172  capsid scaffolding  46.9 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1938  bacteriophage protein  49.64 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.168688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3290  phage capsid scaffolding  41.46 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4324  phage capsid scaffolding protein GpO  46.1 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3051  phage capsid scaffolding protein GpO  46.1 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.826647  hitchhiker  0.00000559875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4836  capsid scaffolding  42.95 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01362  phage capsid scaffolding protein (GPO)  37.98 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.105986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37600  Phage P2 capsid scaffolding gpO-like protein  46.26 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2915  capsid scaffolding  41.91 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0206  capsid scaffolding  40.27 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0696  phage capsid scaffolding  40.43 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1056  phage capsid scaffolding protein (GPO)  39.42 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1471  phage capsid scaffolding  39.1 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2766  phage capsid scaffolding  39.1 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.752968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1283  phage capsid scaffolding  34.48 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2506  hypothetical protein  35.97 
 
 		 142 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0898  putative capsid scaffolding protein  38.41 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0703  scaffold  38.06 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5053  scaffold  38.06 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0240  capsid scaffolding  30.88 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0721  phage capsid scaffolding  33.09 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05026  hypothetical protein  35.07 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1027  phage capsid scaffolding protein  27.54 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0586  hypothetical protein  32.91 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.689959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2799  scaffold protein  38.35 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0772  probable capsid scaffolding protein  28.36 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0942  capsid scaffolding  34.29 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3492  phage capsid scaffolding protein  29.82 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.41374e-21 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2935  phage capsid scaffolding  33.09 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.67209e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2620  L-alanyl-D-glutamate peptidase  43.48 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2690  L-alanyl-D-glutamate peptidase  42.39 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3591  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.83 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0129413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0780  putative membrane protein, putative phage gene  31.78 
 
 		 132 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0381864  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3454  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.88 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.594088  normal  0.915098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2260  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.57 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253408  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0036  cell wall biogenesis enzyme-like protein  37.88 
 
 		 146 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>